据史书记载，成吉思汗临终遗言有三：一是蒙古汗位继承的问题。他反复给自己的儿子们讲多头蛇的故事，警告儿子们要认识到团结的重要性，并直接告诉自己的儿子们要遵从他的旨意，拥立三儿子窝阔台为汗位继承人，把帝国的权柄交给窝阔台，并且要儿子们立下文书，保证把他的决定当成肉体上的灵魂，不许惹起祸端，更不能违反他的法令。二是提出“联宋灭金”计划和方案。他说，金朝的精兵在潼关一线，南接连山，北靠大河，一时难以攻破取胜。只有联合宋朝，让宋朝举兵唐、邓一线，逼近大梁。金兵必然增兵潼关。金兵千里增援潼关，人马疲惫之时，汗国再出兵一举破金。三是指出消灭西夏的方法。他告诉自己的部众，等他驾崩后，封锁消息，密不发葬。等待西夏兵众从城里出来时，择机将其歼灭。一代天骄的“六盘山遗嘱”，最终生效，对蒙古汗国消灭西夏和金国的战争中得到了应验。
长期以来，关于成吉思汗的去世地点有3种说法：宁夏六盘山、甘肃清水县、宁夏灵武。他们的根据是：成吉思汗病逝时正值炎炎盛夏，在当时的交通条件下遗体不便于长途移动、送到远处安葬。但这样的观点也没有得到广泛认同。成吉思汗墓地成为难解之谜与蒙古族独特的丧葬习俗有直接关系。按习俗，蒙古“汗”的墓地都是保密的，地面无迹可寻。据史书记载，蒙古族的王公贵族死后的遗体多被装入凿空的粗木之中深埋地下。下葬后，人们在母骆驼的面前杀死子骆驼，然后放马将留有子骆驼血迹的地面踏平，再派兵守护，直到地面长出青草、与周围的土地毫无异样之后才撤兵而去。此后如果要到墓地祭祀，则由母骆驼引路，它们悲鸣的地方就是墓地。成吉思汗墓葬地点的扑朔迷离，更给六盘山蒙上了一层神秘的色彩。
成吉思汗在宁夏南部的六盘山一带度过了最后岁月，这一点是毋庸置疑的。成吉思汗病逝后，再到蒙哥汗即位时，将京兆(今西安)列为忽必烈的封地。忽必烈重用汉人，推行汉法，得到了关中百姓的爱戴。1253年，忽必烈驻军六盘山，与蒙传佛教萨迦派结成了深厚的政治和宗教关系，并多次会见八思巴，接受宗教灌顶。这一切对后来西藏纳入中国的版图和祖国的统一，都尤为重要。
1258年，蒙哥汗率军进攻宋国，六盘山为进攻宋国的军事基地和后勤保障的大本营，并且后续驻兵2万于六盘山地区。是年，蒙哥汗的夫人也在六盘山病逝。蒙哥汗死后，忽必烈和弟弟阿里不哥争夺汗位，六盘山又成了西部主战场。后来，忽必烈的儿子忙哥剌被封为安西王，安西王府所在地是固原地区的开城，那也属于六盘山地区。忙哥剌的儿子阿难答继承安西王王位后，由于政治上的不成熟，将自己卷入元朝皇位之争，最终失败，直接导致安西王的王号被废除。
1206年蒙古大汉建国到1368年元朝灭亡，共162年。期间，和六盘山发生政治和军事联系的，断断续续算起来就有80余年。蒙元政权在胶着和飘忽的162年里，无论经历了多少祸福兴衰，六盘山地区都是历史上有事实记载的见证地。