孙何字汉公，蔡州汝阳人。祖父孙镒，唐末秦宗权占据蔡州，强迫以宾佐起用他。孙镒假装有病不应召，回到家中，以传授学业为职。父亲孙庸，字鼎臣，显德(954～959)年间，敬献《赞圣策》九篇，引用唐贞观年间的政事，以魏玄成自比。得到对策的机会，其言说：“武力不可滥用，聚敛不可深重，奢侈不可放纵，欲望不可达到极点。”后周世宗认为其言奇异，让孙庸考试中书，补为开封兵曹掾。建隆(960～963)初年，任河南县主簿。太平兴国六年(981)，鸿胪少卿刘章向朝廷推举他，改任左赞善大夫。先后任殿中丞、龙州知州而死。
孙何十岁就懂得音韵，十五岁时能写文章，坚持学习，嗜好古文，所写文章一定依照经义，在贡生中很有名声。孙何和丁谓一样有名且友善，当时人称之为“孙丁”。王禹翶特别推重孙何。曾经作《两晋名臣赞》、《宋诗》二十篇、《春秋意》、《尊儒教议》，闻名于世。淳化三年(992)推举为进士，在开封府、礼部都是第一个被推荐，进士及第又获得甲科，解褐将作监丞、通判陕州。奉召入直史馆，赐予绯衣，升任秘书丞、京西转运副使。任右正言，改任右司谏。
真宗初年，孙何敬献五条奏议：第一，请选拔有谋略的儒生大臣统领军队；第二，请让世代官禄之家子弟在太学学习，寒门才智出众之人由州郡推荐，严禁送礼自行介绍；第三，请恢复制举；第四，请实行乡饮酒礼；第五，请按照能力授予官职，不要凭借皇恩庆典来升任官职。真宗看后认为很好。咸平二年(999)，列举入..的旧例，孙何依次担当待制，于是敬献奏疏说：
六卿各有职分，这是国家的大权。吏部根据考核的成绩来培养人才，兵部检阅军队治理军事装备，户部划正版图丰富财物，刑部严肃纪律诛杀强暴，礼部祭祀神灵选拔贤才，工部修缮宫室整治堤防，六职完备天下之事也就完备了。因此周代的会府，汉代的尚书，都是国家生存的根本，掌握着百官升迁的标准。令、仆统率下属，丞、部各负其责，二十四司如众星拱月一样灿烂，郎中、员外郎分别胜任其职，主事、令史尽职办事。四海九州之大，犹如网在纲上，纲举目张。
唐朝盛时，也没有听说分权别利，首创置使者名目，但军事费用充足。到唐玄宗萌发了奢侈之心，广泛发布各种诏令，租调供应不充足，这样萧景、杨钊开始用地官判度支，宇文融为租调地税使，谋利之洞开始出现，构成了以后祸患的基础。到唐肃宗、代宗时，有司的职责全部废弃，到处都是求利之臣。这样导致叛乱频繁，国家军费不足，被战争时限逼迫，为国家生计所迫，由于救当时之急，都是用暂时适合的办法来衡量一切事务。五代存在时间很短，对此没有这样反思。
现在国家已三代相继，不用武力，建立太平之世，建立各种法规，都在这时了。应将三部官吏名额，归还六卿，谨慎地选择户部尚书一人，专门经营盐铁使事让金部郎中、员外郎处理。又选择本行侍郎二人，分别掌管度支、户部使事，让本曹郎中、员外郎各自处理。这样从三使到判官，虽然名称没有了但实际还存在着。再让左右司郎中、员外郎总管账目，分清类别加以核实，也起到避嫌和监督作用。官吏职责一定，各种规章制度已经确定，这样国家征收赋税不用担心有用苛捐重税盘剥之虑，不征收时也有详细明白的原因，周代的官制唐代的样式，就可以恢复了。这种事情并不艰难，只要陛下实行就可以了。
这年冬天，孙何跟随真宗巡视大名，受诏询问边疆之事。孙何上疏说：
陛下即位以来，训练军队选择将领，可以说做了许多为国之事，有高祖宽广大度的心胸，兼有萧王的慈爱之心，雄健威武为百王之首，兵力强劲要超过前代好几倍。统兵的将帅，应当以身先士卒为意念，以陷害抛弃君父作为耻辱。边城相望，各种壁垒完备，手中掌握有强劲的兵力，但由于谋算有误，于是让敌人得利，兵马横行，抢劫焚烧郡县，捆绑祸害我国百姓。陛下替天行道，怜悯河朔的老百姓，于是率领军队，亲自到澶州、魏州，一声怒吼，敌人四处逃窜，尽管镇、定敌军已退，但德州、棣州仍战祸不断，这恐怕是或者选将不当，或者上奏军报被耽搁，相邻的军队不相救援，军粮需要等待运输而造成的。将帅怎么样？有的依仗勇猛但没有谋略，有的互相嫉妒轻视敌人，只保全城堡不怜悯百姓。边疆上奏军情怎么样？保卫边疆的大臣，只保住官位拿到一定的俸禄，城池被焚烧抢劫，不将实际情况上报，老百姓被敌军所杀，假托是其他强盗所杀。不救援者怎么样？在边疆的州县，城池交错，就好像辅和车唇齿互相依托，像头目手脚互相保护，托言兵力少不救援其他部队，或者等待上奏以后才能出兵。等待军粮运输的怎么样呢？敌军骑兵往返来回，如犬奔驰鸟飞逝一样，速度极快，征召很多运输粮食的民夫，待征收到许多粮食才开始运输，等到我军运来粮食时，敌人就已经逃走了。这四点，都是现在急待解决的事情。选择将帅，不如在文官武臣之内加以选用，用谋臣来辅佐；防止上奏被阻塞，不如凡是边防上奏，陛下亲自披览并在朝廷上询问；交战时需要救援，不如用军令来督促，让将帅们见机行事；运输军粮，不如携带财物派骑兵快速运送，来与敌军骑兵的矫捷相抗。
现在陛下既已驻扎在邺下，契丹始终不敢萌生南下侵略之心，陛下要考虑的是，只是东北边境没有完备的战防，修缮城池完备边防，不能不慎重。况且蜂虿这种毒虫有毒，豺狼没有满足的时候。如今契丹西边害怕大军，北边又没有退路，野兽走投无路就会拼命，对他们不能轻视，遗留的敌军尚待加以诛杀，战败逃跑的敌军我们也应该有所防备。大河渡口，到处都有，也希望陛下根据地域大小驻扎军队，扼守要害之处，这样敌军请求议和的使者，不久就会前来。
真宗披览了孙何的奏书并加以赞赏。等到傅潜延误扰乱军事计划无功而返，孙何上疏请将傅潜斩首示众。不久权户部判官，离京担任京东转运副使，又上疏请求选择州县守宰，减少三司多余的官员，慎重地选择法官，增加俸禄提高品级。不久，调任两浙转运使，兼起居舍人。景德(1004～1007)初年，代职还京，判太常礼院。不久与晁迥、陈尧咨共同被任命为知制诰，赐予金紫官服，主管三班院。在此之前，孙何已经有病在身，勉强任职，一天，在朝中上奏言事，将奏牍掉在地上，弯腰去拾奏牍，又将朝笏掉在地上。有司以有失礼仪对孙何加以弹劾，真宗下诏不予追究。孙何感到惭愧，上章请求改任少卿监，分司西京养病，真宗没有允许，在官宅赐予允许休假，派遣医生前去诊断探视。医生劝勉孙何这样的身体应当保养，孙何回答说：“死和生都是上天安排好的。”最终不听劝告。这年冬天，死，终年四十四岁。真宗在澶渊，听到孙何死的消息感到怜悯痛惜，选录孙何的儿子孙言任大理评事。
孙何乐于名教，经常接见文士，对有作词才能的年轻学士，一定给予称赞和表扬。但孙何性情急躁，不能容忍别人的过失。在浙右期间专断严厉苛刻，州郡之人对此很忧虑。孙何好学，写有《驳史通》十余篇，有文集四十卷。弟弟孙仅。