吴瞞字唐卿，吴..的弟弟。年少时爱好骑马射箭，随从吴..征战，立功升官到..门宣赞舍人。绍兴元年(1131)，箭瞞关之战时，隔断没立与乌鲁折合的部队，使他们不能会合，金兵北逃，吴瞞立功最多，朝廷破格提升他为和尚原兵马统制，于是吴..驻兵河池，吴瞞专门守卫和尚原。等到兀..大举入侵，吴..兄弟拼死守卫。金兵阵势集中分散三十多次，吴瞞随机应变，到神坌发起伏兵，金军大败，兀..中流矢负伤逃遁。张俊秉承朝廷命令任命吴瞞为泾原路马步军副都总管，晋升为康州团练使。
绍兴三年(1133)，升为荣州防御使、知秦州，管辖阶、文州。这年，吴..在祖溪岭失利，当时吴瞞还在和尚原，吴..命令吴瞞放弃和尚原在仙人关列营扎寨，以防止金军深入。绍兴四年(1134)，兀..、撒离喝果然率十万大军到仙人关下，吴瞞从武、阶路率兵增援。先写信送给吴..，说杀金平地势开阔，前面的防线分散漫长，必须在后面险隘地区建立第二道防线，然后才能够战胜敌人。吴..采纳这一意见，急忙修筑第二道防线。吴瞞在敌人的包围中接连转战，同吴..会合于仙人关。敌人果然极力进攻第二道防线，众将中有人请求另选险要地形守御，吴瞞激奋地说：“两军刚刚交锋而退走，这是不战而败，我估计敌人不久就要撤走，诸君只管忍耐。”擂鼓换旗，连日血战。金军大败，兀..、撒离喝两人从此之后数年期间不敢窥视四川。
捷报传告朝廷，升任定国军承宣使、熙河兰廓路经略安抚使、知熙州。绍兴六年(1136)，朝廷新设行营两护军，吴瞞任左护军统制。绍兴九年(1139)，升任都统制，不久又任秦凤路经略安抚使、知秦州。吴..去世后，朝廷授予吴瞞为龙、神卫四厢都指挥使。
当时金朝废黜刘豫，归还河南、陕西地区。楼火召出使陕西，以可以便宜行事的身份打算任命三位将领分区守卫陕西，以郭浩为..延路首领，杨政为熙河路首领，吴瞞为秦凤路首领，准备把川口各军全部移驻到陕西。吴瞞说“：金朝反复无常难以信任，恐怕会发生变故。现在我移居陕西，蜀口一带空虚，敌人如果从南山截击我陕右的军队，直捣川口，我不战而自败。应当暂且依托山险为营寨，控制要害地区，等到看见敌人真实情况精疲力尽时，再逐渐图谋进据陕西地区。”楼火召采纳了他的意见，命令吴瞞和杨政两军屯驻内地保卫四川，郭浩一军屯驻延安以守卫陕西。
不久胡世将以四川制置使的身份权任宣抚司事务，来到河池，吴瞞会见他说“：金军大部队屯驻于河中府，中间只隔着大庆一座桥梁，骑兵奔驰而来，不用五天时间就能到达川口。我军远在陕西，紧急之时不能集结，关口险隘没有修缮，粮运道路断绝，这正是生死存亡的关键时刻。吴瞞的家庭亲族固然不足怜悯，但对于国家大事却不可不虑！”当时朝廷依赖讲和忘记战备，打算放弃仙人关。于是胡世将拒绝接受朝廷命令上奏说“：应当对外坚持讲和欢好，内部加强防御守备，今天部署军队，应使陕西、四川互相连接，近日士兵宫贺仔侦察了解到撒离喝曾密谋说：‘要进入四川并不难，只要放弃陕西不顾，三五年宋军必来占据，陕西山川道路我已全部了解，一旦出兵必然夺取四川。’敌情像这样，万一果然如此，那我就应该做破坏敌人谋略的准备，仙人关不宜急忙放弃，鱼关仓也应该屯积粮饷。”于是吴瞞只派一名小校率三队士兵奔赴秦州，留下大军守备阶、成州山寨，告诫众将不得撤除守备。不久胡世将被任命为真正的宣抚使，置宣抚司于河池。
绍兴十年(1140)，金人毁弃盟约，朝廷诏令吴瞞指挥陕西各路兵马。撒离喝渡河进入长安，直扑凤翔，陕右各军被阻隔在敌人后方，远近都十分震惊恐慌。当时杨政在巩州，郭浩在..延，只有吴瞞随从胡世将在河池。胡世将急忙召集众将商议对策，只有泾原将田晟和杨政一同赶至，参谋官孙渥说河池不能守御，想退保仙人原，吴瞞严厉地斥责他说：“懦弱的言论沮丧我军士气，应该斩首！吴瞞请求用全家百口性命做保击破敌军。”胡世将激励他，并指着自己所居的军帐说“：世将立誓死于此地！”于是派遣孙渥到泾原，命令田晟率三千人迎战。吴瞞又派遣姚仲在石壁寨抵御敌人，将金军击败。诏令他指挥陕西各路军队。
吴瞞写信给金将约战，金将鹘眼郎君率领三千名骑兵攻击吴瞞的军队，吴瞞派李师颜率精锐骑兵将敌军击退。鹘眼郎君败入扶风，吴瞞又攻拔扶风，俘虏金军三位将领及一百一十七人。撒离喝十分恼怒，自率军在百通坊同宋军交战，排开二十里的阵势。吴瞞派姚仲极力苦战击败撒离喝军队，朝廷授予吴瞞为镇西军节度使，升任侍卫步军都虞候。绍兴十一年(1141)，吴瞞同金统军胡盏在剡家湾大战，击败胡盏，收复秦州及陕右各州郡。
当初，胡盏同习不祝会合军队五万人屯驻在刘家圈，吴瞞请求进攻他们。胡世将询问进攻的计策，吴瞞说：“有一种新近创立的叠阵法：再次战斗，将长枪手部署在前面，坐下而不能站起；其次是强大的弓箭，再次是强劲的弩，士兵屈膝跪立等待；最后是神臂弓。敌军前来进攻大约至一百步以内，就先用神臂弓箭击；到七十步内，用强弓齐射；就这样依次击敌。凡是布列阵势，用拒马木做屏障，其间用铁钩互相连接，等到毁坏之后就用新的替代。替代之时击鼓为号。骑兵分两翼布列在前面掩护，阵势布成后骑兵后撤，称之为‘叠阵’。”众将开始时还私下议论说“：我军不会被歼灭在此地吧？”吴瞞回答说“：这是古代约束部伍的法令，古代军法上有记载，诸君不知道罢了。得车战的遗意，古兵法之奇，无出于此者，将士心情安定就能持久，敌军即使士气旺盛，也不能抵挡。”等到同胡盏和习不祝相遇时，便使用这种战法。
胡盏和习不祝精通军事，占据险阻自固，前面面临峻岭，后面控制腊家城，以为宋军必然不敢轻易冒犯。战斗的前一天，吴瞞召会众将询问攻敌的方法，姚仲说“：同敌人在山上交战就能胜利，在山下交战就会失败。”吴瞞认为他说得对，于是告知敌军请求决战，敌军讥笑他。吴瞞半夜时分派遣姚仲和王彦衔枚登上山岭，约定两人登上山岭后发火为号。两将到达山岭后，四周寂静听不到声音，军队布列完毕之后，万把火炬一齐点燃，金军惊骇地说：“我们的事情失败了。”习不祝善长谋画，胡盏善于攻战，两人意见不合。吴瞞先派兵挑战，胡盏果然出兵同吴瞞部鏖战。吴瞞用叠阵法轮番休息作战，自己身披一层薄薄的皮衣立马指挥部队，士卒都殊死搏斗，金军大败。投降的达到一万人，胡盏败退入保腊家城，吴瞞挥军将腊家城包围并发起进攻。腊家城就要攻破时，朝廷用快信诏令吴瞞班师，胡世将长叹停止攻城。次年，宋朝竟将和尚原割让给金朝。撤回戍兵割让土地，都是秦桧主持的。
绍兴十二年(1142)，吴瞞入朝觐见高宗，被高宗拜为检校少师，阶、成、岷、凤四州经略使，赐给汉中田地五十顷。绍兴十四年(1144)，朝廷议论将利州路分为东西两路，以吴瞞任西路安抚使，治所兴州，将阶、成、西和、凤、文、龙、兴七州划归他管辖。当时朝廷正坚决同金讲和，而吴瞞治理军队经营武备，常常如同敌军就要到来。绍兴十七年(1147)，朝廷移吴瞞为奉国军节度使，改行营右护军为御前诸军都统制，吴瞞依旧任安抚使。绍兴二十一年(1151)，朝廷因为吴瞞守卫边境安全宁静，拜他为少保。绍兴二十六年(1156)吴瞞领受兴州驻答刂御前诸军都统制职位事务，改判兴州。南宋自渡江以后从没有节度使兼任都统制职务的先例，当时吴瞞已是开府仪同三司，因此改任此职。
绍兴三十一年(1161)，金主完颜亮背叛盟约，朝廷拜吴瞞为四川宣抚使。秋天，完颜亮渡过淮河，派合喜任西元帅，以兵控制大散关，派遣游骑进攻黄牛堡。吴瞞乘坐肩舆上杀金平，将军队驻扎在青野原，增调内地州郡兵分道前进，授给进取的方法谋略。制置使王刚中前来会见吴瞞商计对策，吴瞞不久即将檄文传告契丹、西夏及山东、河北，声讨金朝的罪行。不久，朝廷任命他兼任陕西、河东招讨使。吴瞞因病返回兴州，总领王之望快信报告当朝执政，说吴瞞多病，突然发生紧急情况，四川形势必然危险。请求让吴瞞的侄儿京襄守将吴拱回到四川，以协助西线军事。共上报五封书信而朝廷没有回答。当时吴瞞病情已十分严重，又带病来到仙人关。
绍兴三十二年(1162)，吴瞞派遣姚仲攻取巩州，王彦屯驻商、虢、陕、华等州，惠逢攻取熙河。有的久攻不下，有的得而复失，最终没有成功。金军占据大散关六十多天，双方对峙不分胜负。姚仲舍弃巩州转攻德顺已超过四十天，吴瞞以知夔州李师彦取代他，派遣自己的儿子吴挺指挥兵马。吴挺与敌人在瓦亭交战，击败敌人。吴瞞亲自率军至城下，守卫城墙的敌兵听说高呼“相公来了”，互相观望议论嗟叹，不忍发箭。吴瞞按视巡察各部，预先修治黄河战场工事，斩杀不服从命令的士兵，先用数百名骑兵引诱敌人。敌军鼓声一响，精锐士兵倾城跃出突击吴瞞的部队。吴瞞军由于事先修筑了工事，无不以一当十。到暮色降临时，吴瞞忽然高声传呼：“某将没有极力作战”，士兵更加奋然搏斗，敌军大败，逃入城中。第二天黎明，吴瞞再次派出军队，敌人坚壁不动。恰逢天刮大风电闪雷鸣，金军拔营退走，共八天时间攻克德顺城。吴瞞进入城中，集市照常营业，父老百姓拥住他的坐骑欢迎叩拜的连绵不断。吴瞞不久返回河池。
四月，原州被金军包围，吴瞞命令姚仲率领德顺的兵力前往救援，吴瞞亲自前往凤翔视察军队。众将虽然极力苦战，敌人进攻更加急迫，增加兵力达到七万人。五月，姚仲同敌人在原州的北岭展开激战，姚仲遭到失败。当初，姚仲从德州到原州，自九龙泉登上北岭，命令各军小心戒备慢慢行进。以卢士敏部为前锋，所部六千军士分为四阵，姚志部为后卫。随着地形便利排列阵势，同敌人鏖战数十个回合。恰逢辎重车队随行扰乱了阵形，敌军冲击，姚仲军于是溃败，丧失将领三十多人。开始，吴瞞出兵时，王之望曾经说：“这次行动士兵的斗志士气，已不如前时候旺盛锐利，姚仲今年以来数次发生意外，不能委派他担任重要职位。”等到姚仲至原州，吴瞞也写信给姚仲，说原州之围不能立即解除，暂且还回德顺。书信未到而姚仲已经失败，吴瞞也无功而返。不久解除姚仲兵权，准备把他处死，因有人劝说作罢，把他囚禁在河池监狱之中。
孝宗即位以后，赐给吴瞞书信，命令他兼任陕西、河东路宣抚招讨使。吴瞞估计金军必然再次争夺德顺，急忙奔赴德顺城下，而完颜悉烈等率领十多万大军果然前来进攻。金万户豁豁又领精兵从凤翔随即赶到。吴瞞在东山修筑堡垒守卫，金兵极力争夺，被杀伤大半，而最终没能攻克城堡。当时议论者认为大军驻扎在外，距离川口遥远，恐怕敌人袭击，打算放弃三路。于是诏令吴瞞退兵。敌人乘机在后面尾追，吴瞞将士伤亡甚多，三路又被敌人占有。朝廷拜吴瞞为少傅。隆兴二年(1164)冬天，金军入侵岷州，吴瞞率兵至祁山，金军听说这一消息，退兵，派遣使者前来通告说“：两国已经修好讲和了。”恰逢诏令到达，于是双方都解兵而退。
沈介任四川安抚、制置使，同吴瞞议论不合，兵部侍郎胡铨上书，其中有不少话语涉及到吴瞞。吴瞞拒绝诏令请求到朝廷，孝宗亲自写信准许他前来。还没到一半路程，吴瞞请求罢免宣抚使和退休，都没被允许。乾道元年(1165)吴瞞来到京城，孝宗派遣宦官前往慰问，并在便殿召见他，准许他到德寿宫朝见高宗。高宗接见吴瞞，叹息说：“我与你，是老君老臣了，可以数次前来见我。”吴瞞叩首感谢。高宗和孝宗派往慰劳吴瞞的使者前后相继，又命皇太子前去看望。朝廷拜吴瞞为太傅，封为新安郡王。过了数天，诏令吴瞞仍任宣抚使，改判兴元府。等到返回四川时，高宗和孝宗设宴饯行十分荣宠。吴瞞到德寿宫向高宗辞行，凄然泪下。高宗也为分别怅然难过，解下所佩带的刀剑赐给吴瞞说“：以后思念我，看到它就可以了。”
吴瞞到达汉中，修复褒城旧坝，灌溉田地数千顷，民众感到十分便利。乾道三年(1167)，吴瞞去世，终年六十六岁。朝廷赠太师官衔，追封他为信王。孝宗震惊哀悼，停止两天上朝视事，加倍赠送财物给家属置办丧礼。高宗也赐给白银一千两。当初，吴瞞病重，招呼幕僚草拟遗书，命令在书中直接写着：“希望陛下不放弃四川，不要轻易出兵。”而没有言语说到自己的家事，人人称赞他的忠诚。
吴瞞刚强勇敢，喜爱大节，忽略小节，阅读史书通晓大义。代替兄长吴..为将后，守卫四川二十多年，俨然为方面重臣，威名仅次于吴..。高宗曾询问战胜敌人的方法，吴瞞回答说：“先派老弱出战，然后用精锐继后跟进。”高宗说：“这是孙膑三驷的方法，一败而两胜。”
曾经著作《兵法》两篇，大概意思是说“：金军有四种长处，我军有四种短处，应当避开我的短处，抑制敌人的长处。金军的四项长处一是骑兵强大，二是士兵坚韧，三是身穿重甲，四是善长弓矢。我集中汉和少数民族所长，兼收并用，用分队抑制敌人骑兵；用轮番休战抑制敌人坚韧；抑制敌人重甲，就用强弩劲弓；抑制敌人弓矢，就用远克近，以强制弱。布列阵势的方法，就是用步兵作为阵心、左右两翼，将骑兵布列在左右两肋，拒马木布列在两肋之间，至于临时增加减少的不同，就在于随机应变。”了解军事的人认为有可取之处。
王刚中曾谈论刘钅奇的长处，吴瞞说：“刘钅奇有宽宏的气度，但却没有英雄的气概，天下人都随声附和同声赞誉他，恐怕不能抵挡叛逆完颜亮，吴瞞私下为此忧虑。”王刚中不以为然，刘钅奇果然无功，因忧愤而逝。吴瞞选拔众将都以功劳做标准，有推荐人才的，吴瞞说“：执掌军队的官员如不经过尝试，难以了解他的才能。如果因小小优点而提升他任将，那么投机取巧的人得志，而长期戍边的士兵和久经战阵的老将的心就涣散懈怠了。”